大分郡内的大友家势力投降以后，政良一方面协助盐市丸母子将大友义鉴隆重安葬在了大分郡高岐山上的大山寺中，另外一方面也紧急安排本家军势进行防备布置。
其中，第一常备足轻番队。主将为执行种兼，副将为铁之助、朝仓宗滴、问注所鉴景，军目付为罗氏政秀。驻地由肥后国阿苏郡的石櫃城、汤浦城，更改为丰后国日田郡的日偎城、由布岳中的山间关卡，以及玖珠郡的日出生城，协助内政阁维持领地的法度推行的同时，主要是防备山脉另一边的丰前国大内家。
第四常备足轻番队。主将木下昌直，副将上田真次、岛原纯茂、赤池长任，军目付罗氏佐助。驻地由丰后国日偎城以及由布岳中的山间关卡，更改为丰后国大分郡以及海部郡位于别府湾沿岸的高崎山城、府内馆、鹤崎城。协助内政阁维持领地的法度推行的同时，主要负责防备北面丰后国大友家速见郡以及国东郡的豪族军势以及确保别府湾沿海安全。
第六常备足轻番队。驻地为丰后国的海部郡的中谷峠、津久见湾、臼杵湾地区。至于日向的中山城，只需留下少量军势驻守则可，但不能打出罗氏家的旗帜，只能暗中驻守。主将为圆城寺信胤，副将为公文重忠、黑木实连、丸目赖美，军目付为锅岛直茂。协助内政阁维持领地的法度的同时，主要是防备丰后海部郡的佐伯家以及日向的伊东家。
此时第六番队圆城寺信胤、公文重忠两人正率领着三百常备足轻以及五百农兵，占据着海部郡津久见湾与佐伯湾交界处高平山的制高点与奔赴而来的佐伯家军势对峙着。原来与佐伯家对峙的高坂昌信则是被政良另外委派了任务。
而本多俊正与本多正信两父子更加是率领着一千农兵将直入郡北志贺家的本城高城给围困住。这个志贺亲度在历史上却是个软骨头来的，在得罪大友家的新任家督大友义统后不得不提前将家督之位传给自己的儿子志贺亲次，但是却因此而记恨上大友义统。当日后岛津家大军入侵时，他是与入田义实第一时间投降的。但是现在，他却不知道为何如此顽固，在丰后大部分地区都落入罗氏家的手中，并且候任家督也向罗氏家投降了的情况下，他仍然死咬着牙不愿意开城投降。政良只好继续派人将他围困在城中了。
骑兵方面，第一常备骑兵番队的驻地仍然为筑后国的柳川城，以便随时支援肥前国、肥后国、筑前国以及丰后国地区。主将为矶野员昌，副将为赤穴光清、田尾中元。但是其原本五百人的常备骑兵编制却缩减为四百人的编制，减去的一百骑兵自动升级为第二常备骑兵番队。其主将则是高坂昌信。
经过这四、五年在军队中的锻炼，当初稚嫩的高坂昌信已经成长为了一个合格的大将。再加上他的统率、武勇以及骑马技术都不错，所以政良决定提前让其独挡一面，于是干脆让其单独带领一支一百人编制的骑兵番队。这支番队的驻扎地点为府内馆，将负责整个丰后地区罗氏家领地的日常的治安（近期的巡逻重点是大野郡与海部郡），随时准备支援木下昌直以及圆城寺信胤所在的第四、第六常备足轻番队，同时协助内政阁推行本家法度。
水军方面，此次丰后水军为罗氏家增加了三十二艘关船，五十一艘小早，老弱水军八百多人。但是对于这样的水上的战力，政良显然是不满的，所以他决定将现在的八百多人水军只留下强壮的人员，其余被淘汰的人员则是为他们分配田地，让他们恢复农耕。
一番淘汰之后，八百多人只剩下二百多人，政良立即从第一、二、三个本家水军常备番队中合共抽调了三百多人过来（原第一、二、三个本家水军常备番队因此减少的兵员可以立即进行补充），与这二百人组成了六百人的罗氏家第四常备水军番队，并且将村上武吉、宇久纯定、宇土行兴调动到第四番队，与若林越后守共同组成以村上武吉、若林越后守为主将，宇久纯定、宇土行兴为副将，统辖关船三十二艘，小早五十一艘的第四常备水军番队，驻地分别为别府湾的鹤崎城以及臼杵湾的栗山城，负责维护别府湾、臼杵湾以及津久见湾的安全，同时对这三处港湾的沿海实施海禁（禁商、禁渔），禁止其他一切非本家的船只在这些海域航行。
而增加了这新建立的六百人第四常备水军番队以后，罗氏家的常备已经有八千三百人。这八千三百人是长期在作战状态的士兵，在正式作战之时，罗氏家还会根据情况临时征募在村子中保持每月训练四日的农兵。在各番队的一些驻地当中，为了防守，还会定期招募一些可靠的农兵协助防守（通常为三个月更换一批农兵）。
而地点位于肥前国松浦郡野高山脚下的新兵训练营，还会定期根据各地募兵所的领民报名从军情况以及各番队的常备战损情况制定募兵以及训练计划，然后定期提前组织一部分报名及格人员进行免费军训（这些人相当于正式预备役了，一旦开战，因为此前享受了免费的定期训练，所以是要优先被征募的。他们的战斗力要比一般的农兵强悍），协助守卫各边境城砦也将是他们的训练内容之一（不但可以免费吃喝地训练，还能够拿到报酬，是非常受罗氏家领民欢迎的，对于一些不愿当农民，而且想出人头地的人尤为具备吸引力）。当各番队真的需要补充常备的时候，新招募的新兵们将集中在训练中进行最少为期一个月的训练，然后再被分配到各番队去。
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