后来听说元朝军队又追击了上来，南宋朝廷只得又逃到厓山。元朝将领张弘范，带领军偷偷到达潮阳，首先袭击和逮捕了文天祥，又带兵进攻厓山。张世杰又故技重演，用连接战船的办法，守住了峡口通道，又用水泥涂满了战舰，以防备火箭的攻击。
张弘范对他也毫无办法，只得派遣人员劝告他投降，张世杰不为所动，没有听从他们的劝告。张弘范另外派出军队进行堵截，截断了宋朝军队的取水的通道，宋朝被围困了起来，身处险境，非常危急。
元朝士兵又从四面发起猛烈的攻击，宋朝军队无法抵抗，只得败走，这时就边赤胆忠心的张世杰，也看见宋朝大势已去，都砍断了缆绳，自己突围出去，只带领了十六只小船，夺取了海港，自己逃离开了。陆秀夫为了维护民族的气节，家族尊严，先逼迫着妻子，跳入大海自尽，最后自己背着幼小的皇帝跳进大海，同归于尽。
太后杨氏看到这种悲壮的情景，失声痛哭，大声说道：“我之所以忍受着耻辱，坚强地活了下来，就是为了赵家血统的延续，今天赵家的皇族已经完全灭亡，还有什么盼头呢？，还不如死了干净。”也像陆秀夫他们那样，投入大海死亡。
赵昺，曾先后封为信王、广王、卫王。临安危急时，他在母亲杨淑妃带领下，暗暗出城，逃到泉州，即今天的福建省泉州市。宋端宗于景炎三年，公元1278年4月病死，赵昺被陆秀夫，张世杰于同月冈州拥立为帝，5月，改年号为“祥兴”，6月，迁到崖山，今广东省新会县南。
与此同时，南宋右丞相文天祥在五坡岭，今广东海丰，被元军统帅张弘范的弟弟张弘正所俘，其统领的督军府从此瓦解。宋幼主祥兴二年，公元1279年，正月，元将张弘范率水陆两路元军直趋崖山。
崖山背山面海，地势险要，张世杰下令焚烧岛上行宫军屋，人马全部登船，然后依山面海，将一千多条战船排成长蛇阵，用绳束连接在一起，船的四周筑起城楼，船上涂上一层厚厚的湿泥，缚上一根根长木。将帝昺的座船安置在中间，诏示将士与舰船共存亡。
张弘范见宋军战船集结，行动不便，就先用小船装满柴草，浇上油，点火后乘风攻击宋水军。宋军船上的湿泥阻止了火势蔓延，长木又顶住了火船，使元军的火攻归于失败。张弘范又阻断了宋军的水源，封锁了海口。宋兵饥渴交加，处境日益困难。张弘范派人劝降，被张世杰拒绝。2月6日，双方进行了最后的决战，张弘范分兵四路，发动猛攻。
宋军正在拼命抵抗时，忽听得张弘范所在的指挥船上奏起了音乐。宋军以为这是元军将领在举行宴会，战斗就松懈了一下。不料此乐声是元军总攻的讯号，张弘范的指挥船直扑而来，箭如暴雨。元军在乱箭掩护下，夺走了宋军的战船七艘。各路元军又一齐猛扑过来，从中午到傍晚，海战进行得异常激烈。
忽然，张世杰见到一条宋船降下了旗帜，停止了抵抗，其他战船也降下旗帜，知道大势已去，急忙一面将精兵集中到中军，一面派出一只小船和十多名士兵去接帝昺前来，准备突围。
皇帝赵昺这时正由左丞相陆秀夫守护着，待在一艘大船上。小船来接帝昺，陆秀夫不知这是真是假，又担心帝昺如突围不成而被元军截获，坚决拒绝。他知道君臣都难以脱身了，就连忙跨上自己的座船，仗剑驱使自己的妻子投海自尽。
然后，换上朝服，回到大船礼拜帝昺，哭着说：“陛下，国事至今一败涂地，陛下理应为国殉身。德祐皇帝，也就是宋恭帝，当年被掳北上，已经使国家遭受了极大的耻辱，今日陛下万万不能再重蹈覆辙了！”帝昺则给吓得哭作一团。陆秀夫说完，将黄金国玺系在腰间，背起九岁的帝昺奋身跃入大海，以身殉国。
顷刻间君臣二人就沉没得无影无踪。其他船上的大臣，宫眷，将士听到这个噩耗，顿时哭声震天，几万人纷纷投海殉国。张世杰率领水军余部突围而出来到海陵山脚下，不久，有人带来了陆秀夫背负帝昺共同殉国的噩耗。张世杰悲痛不已，此时，飓风再来，部下劝他上岸暂避。张世杰俯视着在风粮中飘摇的宋军残船，拒绝暂避。
绝望地回答：“无济于事了，还是与诸君共甘苦吧”又说道：“我为赵氏，也算竭力了，一君身亡，复立一君，如今又亡，我在崖山没有殉身，是望元军退后，再立新君，然而，国事发展到如此地步，难道这是天意。”说完堕身入海。南宋灭亡。
张世杰到达海陵山下的时候，刚好遇到狂风大作的气候，他就就燃起香烛，对天祷告说：“我为了宋朝的赵氏江山，也算是竭尽全力了，一个君王灭亡后，我们又拥立了一个君王。今天新的皇帝又灭亡了，但是我还没有死亡，还希望在敌军撤退后，另外拥立一个姓赵的人才维系赵家的血统。如果上天一定要让赵氏家族灭亡，管理台风的神灵，就赶快打翻我的战船，让我们葬身海底吧！”说完话，战船果然被打翻，张世杰也落入海中死亡。
宋朝，960年建国，1279年灭亡，是中国历史上的一个朝代，根据首都及疆域的变迁，可再分为北宋与南宋，合称两宋。
宋太祖在建国时为了避免安史之乱以来藩镇割据和宦官乱政的悲剧，遂采取重内轻外和重文轻武的施政方针，一方面有利于经济与文化的繁荣。但另一方面也因此导致武力积弱不敌北方外敌，对西夏及辽用兵均无功。
1126年至1127年发生靖康之变使徽、钦二宗受金人掳去，迫使宋室南迁建都临安，与入侵的金国以淮水到大散关为界，史称南宋，而将此前建都汴梁历史称北宋。
1276年，都城临安陷落，南宋亡于蒙古统治者忽必烈建立的元帝国。
宋朝自太祖皇帝至皇帝赵昺，共经历了三百二十年，如果从向南迁都的时间算起，一共经历了一百五十二年。宋朝的赵氏江山从此彻底灭亡。
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