不过在另一时空里，在郑芝龙被清军挟持之后，郑成功差不多花了近一年的准备时间，才开始正式出兵抗清，虽然取得了一些成果，但终于是因为郑成功崛起的时间太晚，南眀的最好机遇，已经错过了。
而现在己是七月中旬，跨海突袭，收复南京的计划己经迫在眉睫，商毅也不可能等郑成功慢慢的积攒力量，因此要利用自己的名望，帮助郑成功，尽快扩充实力，整合郑芝龙的余部，让他在短时间內俱备在福建和清军作战的实力。牵制清军的兵力。
郑成功虽然己经誓师起兵，但这时他手下兵不满千，将不过数员，船不过三十余艘，而且安平是弹丸之地，地方狭小，又无险可守，不能做为基础，也可以说是万事艰难。在这种情况下，商毅主动向郑成功表示支持，并且原意给他提供物货军器钱粮，完全就是雪中送碳，而且郑成功对商毅一向敬佩，因此对商毅更是感激万分。
于是郑成功也立刻给商毅回信，向商毅表示了自己的感谢之情。并且表示原意接受商毅的帮助。正好这时驻守南澳的陈豹也派人来向郑成功表示效忠，并且愿意把自己部下的三千余众的兵力全部都交给郑成功指挥。
南澳是位于福建最南端，漳州府与潮州府交界的一个海岛，面积约在近五千平方公里，而是距离陆地只有三十余里的海路，和台湾隔海相望，进可攻，退可守，地历位置十分优跃，一直都是南部沿海的总要岛屿。而陈豹是追随郑芝龙多年的旧部，为郑氏十分忠心，而且在漳州府、潮州府沿岸一带颇有名望。得到了他的帮助和支持，对郑成功起兵，使郑成功在起兵之初，不仅马上扩大了兵力，而且有了一块立足之地，起到至关重要的作用。
因此郑成功也约请商毅，到南澳岛来会面。
收到了郑成功的回信之后，商毅也十分高兴，首先命先驻守台湾的沈寿岳带一个团的兵力，首先赶到南澳岛，和郑成功会面。
这个时侯商毅已经向台湾移民三十余万，加上台湾本地的居民，和从日本掠带过来的人口，总计在商毅治下的人口己经超过了四十万，组成了大小数百个村落。而且和台湾的大部份土著都保持着良好的关糸，现在己经占据了台湾七成以上的土地，并且在北部地区，兴建了基隆、宜兰、新竹、桃源四座城市，还开垦了大量的良田，煤矿、铁矿、金矿等，不仅完全实际了自己自足，而且还能支应浙江一部份物资，也呈现出十分兴旺发达的景像，与荷兰人统制的地区呈现出截然不同的样子。
而原来驻守台湾的沈氏三兄弟中，沈寿崇早就被调理了台湾，现在出任第一军第十师的师长，但沈寿峣和沈寿岳依然还留守台湾，一个担任台湾海军指挥官，一个担任台湾陆军指挥官，不过台湾的驻军，都是隶属于海军部管辖。
现在台湾的驻军有两个正式的步兵团，另有两个民兵团，区别在于步兵团是标准装配步枪和火炮，而民兵团没有装配步枪和火炮，还是使用冷兵器，不过并没有进行师、旅级的编制，而是统称为台湾驻军，另外还有战船三十余条，不过基本都是老式战船，新船不足十艘。
因为台湾离南澳近，而且台湾驻军反正闲着也没事，因此商毅首先派台湾驻军到达南澳岛，作为自己的先行者，同时还给郑成功送来了一批粮食。
现在粮食是郑成功现在最缺少的物资,得到这批粮食之后，也解决了郑成功的一个大问题，于是有更多的人都投奔郑成功，势力也在迅速扩大起来。
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